Laboratório de Biologia Molecular Estrutural – LABIME
  • Bem-Vindo!

    Publicado em 17/12/2021 às 6:11 PM

    Laboratório de Biologia Molecular Estrutural – LABIME

    Departamento de Bioquímica – Centro de Ciências Biológicas

    Coordenador: prof. Dr Hernán Terenzi

    Contato:    


  • PROCEDIMENTOS PARA A SOLICITAÇÃO DE ORÇAMENTO DE ANÁLISES

    Publicado em 17/12/2021 às 6:10 PM

    O Laboratório de Biologia Molecular Estrutural – LABIME passou por algumas reformulações e para melhor atende-los atualizamos nosso sistema de solicitação de análises.

    USUÁRIOS DE ESPECTROMETRIA DE MASSAS E DICROÍSMO CIRCULAR –  SOLICITAÇÃO DE ORÇAMENTO DE ANÁLISES: 

    Para solicitar o orçamento de análises é necessário preencher o FORMULÁRIO DE AMOSTRAS disponível na página do equipamento a ser utilizado (menu esquerdo) e ANEXAR esse documento ASSINADO ao formulário REQUISIÇÃO DE ORÇAMENTO DE ANÁLISE ONLINE .

    A equipe técnica receberá a requisição, avaliará a viabilidade de realização das análises e entrará em contato com o usuário.

    ATENÇÃO:

    Alunos UFSC: não fornecemos os materiais consumíveis para as análises. 

    A rotina de análises do LABIME não envolve a preparação de amostras e interpretação de resultados.

    SERVIÇOS DE LIVRE DEMANDA: coleta de água reagente (destilada, ultrapura e deionizada). Agende aqui -trazer frasco.

    EQUIPAMENTOS DE AGENDAMENTO SIMPLIFICADO: reserva dos computadores de análise de dados de espectrometria de massas (MS, LCMS e MASCOT SERVER). Reserve aqui.

    Publicações com dados adquiridos no LABIME: Solicitamos a citação do LABIME em forma de agradecimento nas publicações  que utilizem os dados de análises realizadas na plataforma (artigos, TCCs, dissertações, teses e trabalhos de congressos e simpósios).

    Em caso de dúvidas pedimos que entre em contato pelo e-mail  .


  • LABIME INCORPORADO AOS LABORATÓRIOS ASSOCIADOS ESPECIALIZADOS EM NANOTECNOLOGIAS DO LINDEN (2021)

    Publicado em 17/12/2021 às 6:07 PM

    Em Outubro de 2021 o LABIME/UFSC passou a integrar o quadro de Laboratórios Associados especializados em nanotecnologias do Laboratório Interdisciplinar para o Desenvolvimento de Nanoestruturas – LINDEN.

    LINDEN agrega os laboratórios de nanotecnologia da UFSC e integra o sistema SisNANO, financiado pelo MCTI. O laboratório está focado no desenho e desenvolvimento de sistemas nano estruturados para aplicações, com o objetivo de obter materiais que apresentam melhorias nas suas propriedades e no seu desempenho

    As atividades de gestão e atendimento do LINDEN estão funcionando nas dependências do Departamento de Engenharia Química e Engenharia de Alimentos, no campus Trindade na Universidade Federal de Santa Catarina – UFSC, e as pesquisas sendo desenvolvidas nos Laboratórios Associados especializados em nanotecnologias do LINDEN.

    LABIME/UFSC contribuirá com as análises de Espectrometria de Massas e técnicas complementares. Para mais informações acesse: Análises e Ensaios – LINDEN.


  • A bióloga do LABIME/UFSC Martina Blank é coautora de estudo e está entre os destaques no Notícias da UFSC!

    Publicado em 15/12/2021 às 2:54 PM

    A bióloga do LABIME/UFSC Martina Blank é coautora de estudo e está entre os destaques no Notícias da UFSC!

    (clique na reportagem)

    Bióloga da UFSC desenvolve protocolo para otimização de análises de biomoléculas e efeitos de medicamentos

     


  • Bióloga do LABIME/UFSC desenvolve protocolo para otimização de análises de biomoléculas e efeitos de medicamentos

    Publicado em 15/12/2021 às 2:32 PM

    A bióloga do Laboratório de Biologia Molecular Estrutural (LABIME) da Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC) Martina Blank é coautora de um estudo que descreve um protocolo para otimização de análises em ensaios celulares para avaliação do perfil de biomoléculas e dos efeitos de medicamentos. O artigo, publicado na edição de novembro da revista científica Nature Protocols, descreve uma técnica bastante versátil, que pode ser aplicada a uma ampla gama de compostos e possibilita análises rápidas e abrangentes, usadas, por exemplo, para averiguar como células respondem a diferentes tratamentos ou para encontrar biomarcadores de doenças.

    O trabalho, que fez parte do pós-doutorado de Martina na universidade alemã Hochschule Mannheim utilizou a técnica de espectrometria de massas Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight (MALDI-TOF-MS), em equipamento similar ao que o LABIME disponibiliza (MALDI autoflex III smartbeam) aos usuários do laboratório do Departamento de Bioquímica do Centro de Ciências Biológicas (BQA/CCB).

    Bióloga da UFSC desenvolve protocolo para otimização de análises de biomoléculas e efeitos de medicamentos


  • Servidora do LABIME é autora de artigo na Nature Protocols

    Publicado em 19/11/2021 às 3:27 PM

     

    A revista científica Nature Protocols traz, em sua edição de novembro de 2021, o artigo “Label-free cell assays to determine compound uptake or drug action using MALDI-TOF mass spectrometry” de Martina Blank, servidora Técnico-Administrativa que atua como bióloga no  Laboratório de Biologia Molecular Estrutural do Departamento de Bioquímica  (LABIME/CCB/UFSC). O tema do artigo em co-autoria é fruto das atividades realizadas no estágio pós-doutoral de Martina na Hochschule Mannheim, Alemanha. A pesquisa descreve um protocolo para otimização de análises de espectrometria de massas em ensaios celulares para avaliação de drogas desenvolvido no Center for Mass Spectrometry and Optical Spectroscopy .

    Link do Artigo: Nature Protocols

    Fonte: DIVULGA UFSC – 19/11/2021 – Edição 1771


  • Suspensão do expediente presencial até 2 de outubro de 2021 – PORTARIA NORMATIVA Nº 390/2021/GR, DE 1º DE ABRIL DE 2021

    Publicado em 03/05/2021 às 1:25 PM

    Prezados usuários,  

    A Administração Central da Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC) prorrogou até 2 de outubro de 2021 “a suspensão do expediente presencial nas atividades técnicas e administrativas em todas as unidades da UFSC” conforme PORTARIA NORMATIVA Nº 390/2021/GR, DE 1º DE ABRIL DE 2021 (Publicação da portaria: BO-UFSC_09.04.2021-1) , que prorroga a suspensão das atividades acadêmicas e administrativas presenciais até 2 de outubro de 2021.

    Seguindo esta orientação o LABIME está com o atendimento presencial suspenso. 

    Porém, considerando a PORTARIA NORMATIVA Nº 399/2021/GR, DE 17 DE JUNHO DE 2021 serão avaliadas pela Coordenação do LABIME as análises consideradas URGENTES:

    1. Review de artigo que possui prazo para resposta.

    2. Proximidade da data de defesa Mestrado ou Doutorado.

    3. Tema da pesquisa relacionada a COVID-19.

    Então havendo uma das situações citadas acima, o usuário deve encaminhar para o e-mail   a JUSTIFICATIVA (clique aqui) assinada pelo Orientador (preferencialmente digital) para avaliação da realização de análise em carácter URGENTE. E, posteriormente, seguir procedimento para solicitação de orçamento de analises.

    Cabe observar que serão adotados todos os protocolos de segurança recomendados pelo Guia de Biossegurança da UFSC.

    Para maiores informações entre em contato através do e-mail .


  • 2021 – NOVA NOMENCLATURA e GESTÃO: LABIME/BQA/CCB

    Publicado em 01/05/2021 às 7:14 PM

    LABORATÓRIO CENTRAL UFSC (2011-2020)

    No período de 2011-2020 sob o nome de Laboratório Central de Biologia Molecular Estrutural (CEBIME) a plataforma integrou a rede de Laboratórios Centrais da UFSC gerenciados pela Pró-Reitoria de Pesquisa – PROPESQ (PORTARIA NORMATIVA N°S 74 /2016/GR de 2 maio de 2016 – Dispõe sobre as normas para a criação, o registro e o funcionamento de laboratórios de pesquisa multiusuários setoriais e centrais na Universidade Federal de Santa Catarina). Em agosto de 2020 a plataforma foi descredenciada da PROPESQ e deixou de integrar o grupo de Laboratórios Centrais Multiusuário (LCM) da UFSC.

    NOVA NOMENCLATURA e GESTÃO (2021)

    Em abril de 2021 a plataforma foi reincorporada ao Departamento de Bioquímica do Centro de Ciências Biológicas da UFSC, local de origem do laboratório, sob o nome de LABORATÓRIO DE BIOLOGIA MOLECULAR ESTRUTURAL – LABIME conforme PORTARIA Nº 476/2021/GR, DE 5 DE ABRIL DE 2021 – publicação BO-UFSC_14.04.2021  sob coordenação do Professor Hernán Terenzi.


  • CAL e CEBIME sediam o curso “Proteômica como ferramenta analítica em biossegurança: Identificação de proteínas por MALDI-TOF/TOF”

    Publicado em 18/05/2017 às 5:30 PM

    Entre os dias 08 e 19 de maio de 2017 o Departamento de Ciência e Tecnologia de Alimentos (CAL) do Centro de Ciências Agrárias (CCA) e o Laboratório Multiusuário de Espectrometria de Massa do CEBIME/PROPESQ da UFSC sediam o curso “Proteômica como ferramenta analítica em biossegurança: Identificação de proteínas por MALDI-TOF/TOF” promovido pelo Centro Brasileiro-Argentino de Biotecnologia (CBAB/CABBIO).

    Participantes do curso CBAB/CABBIO 2017 na UFSC. (Foto: Ítalo Padilha/Agecom/UFSC)

    O curso coordenado pela Profa. Ana Carolina Maisonnave Arisi (CAL/CCA/UFSC) foi financiado pelo CNPq, Chamada CNPq/MCTIC/CBAB Nº 13/2016 e teve como palestrantes  convidados a Dra. Martina Blank (bióloga do CEBIME/PROPESQ/UFSC), a Dra. Rosario Duran (Institut Pasteur de Montevideo/Uruguai), a Dra. Silvina Fadda (CERELA CONICET – Tucuman/ Argentina), o Dr. Pedro Alexandre Valentim-Neto (CAL/UFSC) e o Dr. Emanuel Maltempi de Souza  (Núcleo de Fixação de Nitrogênio/ UFPR).

    Dra. Rosario Duran, M. Eng. Vanessa Oliveira, Dra. Martina Blank, Dra. Silvina Fadda, Prof. Hernán Terenzi e Profa. Ana Carolina Maisonnave Arisi (Foto: Philipe Gabriel/CEBIME/UFSC)

    Para o curso foram selecionados 13 estudantes de doutorado dos países participantes da cooperação internacional de Biotecnologia do CBAB/CABBIO: 6 estudantes brasileiros, 4 estudantes argentinos, 2 estudantes uruguaios e 1 estudante colombiano. O curso ofereceu aulas práticas (48h) e aulas teóricas (32h). As aulas teóricas também foram oferecidas como disciplina da PPGCAL.

    As aulas práticas de espectrometria de massas e identificação de proteínas com busca em banco de dados ocorreram no Laboratório Multiusuário de Espectrometria de Massas do CEBIME utilizando o equipamento MALDI-TOF e foram ministradas pela Dra. Martina Blank e M. Eng. Vanessa Oliveira.

    Participantes do curso CBAB/CABBIO 2017 e alunos PPGCAL/UFSC. (Foto: Vanessa Oliveira/CEBIME/UFSC)
    Palestrante Dra. Martina Blank (Foto: Vanessa Oliveira/CEBIME/UFSC)
    Alunos participantes do curso CBAB/CABBIO 2017 (Foto: Vanessa Oliveira/CEBIME/UFSC)
    Aula prática de excisão de spots do gel bidimensional. Dra. Martina Blank e M. Eng. Vanessa Oliveira do CEBIME junto à aluna de doutorado Gabriela Rossi do PPGCAL (Foto: Daniela Alves/CBAB/CABBIO)
    Excisão do spot do gel bidimensional (Foto: Martina Blank/CEBIME/UFSC)
    Aula prática de digestão de proteínas em gel e aplicação da amostra na placa de MALDI (Foto: Martina Blank/CEBIME/UFSC)
    Aula prática de MALDI-TOF no Laboratório Multiusuário de Espectrometria de Massas do CEBIME (Foto: Vanessa Oliveira/CEBIME/UFSC)

    Mais fotos estão disponíveis na página oficial do curso no Facebook @cursocbabcabbio012017